Allestito presso il lato Nord-Est del chiostro e inaugurato il 20 dicembre 2003, il Museo di Fisica "Antonio Maria Traversi" è stato trasferito nel lato opposto del chiostro (lato Sud-Ovest) a fine anno 2010, inizi 2011. I link qui a lato permettono di sapere com'era il Museo nel periodo 2003-2010.

La "spinta espansiva" nel 2010 che avrebbe portato l'istituto verso, di lì a breve (4 anni), sei sezioni complete (tre di liceo classico e tre di liceo classico europeo) imponeva il reperimento di nuovi locali da adibire ad aule e il necessario e non più procrastinabile spostamento del laboratorio di fisica a piano terra. Di qui la scelta di chiudere un altro lato del chiostro, così come fatto in precedenza per ricavare i due laboratori di informatica, destinandolo al Museo e di spostare il laboratorio di fisica presso la vecchia sala espositiva.